在组织的ISO9001质量体系运行中，势必会产生不合格，这里的不合格包含产品和服务。
对于不合格的评审和处理，组织应从以下几点考虑：
一、发生下列不合格应进行评审：
①业主严重投诉时或在一段时间内（如一个月）业主集中投诉某一项服务时；
②对一个季度“回访记录”和半年一次的业主意见征询结果的统计、分析，发现业主表
达的突出（集中）不满意问题；
③发生重大责任事故时；
④连续两个月，公司下达的质量目标没有完成时。
二、不合格的评审由项目管理部组织，管理者代表主持，以公司主管经理及有关部门主管参加评审会议的形式进行。
三、ISO体系认证中不合格评审的主要内容为：
①确定责任部门或责任者；
②评价影响程度和范围；
③提出处置意见。
四、项目管理部应负责《不合格处置单》落实验证控制，当发生重大问题时报总经理批准。
组织质量管理体系文件的要求至少包含以下两点内容：
1、该写的要写到，写到的一定要做到
质量管理体系文件对进企业需要实施的过程及活动所作出的规定，完全是用来实施的，不能搞形式主义或摆花架子。因此，既要防止脱离标准的要求一味写实，怎么做就怎么写，随意降低对过程/活动的控制要求；又要防止只看标准不顾实际，将一些行不通、做不到的做法写入。必须坚持按照ISO9001:2008标准的要求，结合实践中的经验。
2、符合文件控制的要求
为确保进企业质量管理体系文件处于受控状态，发挥其对内是法规，对外是证实的作用。文件的编制、审核和批准均应由授权人员进行。文件格式、内;容、编号、标识、分发、更改和复印等都要按文件控制的要求进行，确保文件的标准化、规范化。